通过组织多学科的研究力量，包括动物学、植物学、微生物学等相关学科科技人员，对我国热带岛屿与海岸带进行全面、深入的调查和标本采集、保存、鉴定，结合项目主要参加单位馆藏标本与数据的检索、查阅，完成我国热带岛屿和海岸带生物物种编目、我国热带岛屿和海岸带特有生物资源现状与应用前景评估、我国热带岛屿和海岸带红树林的分布状况与保护现状评估、南海诸岛生物资源与保护现状评估。在完成我国热带海岛海岸特有生物资源调查的同时，完成对其外来入侵生物物种及其危害评估，并提供热带海岛海岸生态系统恢复与重建的物种建议。

预期采集、保存一大批热带岛屿和海岸带动物、植物、真菌标本；建成《中国热带岛屿和海岸带生物物种数据库》并编撰《中国热带岛屿和海岸带植物名录》、《中国热带岛屿和海岸带动物名录》、《中国热带岛屿和海岸带真菌名录》、出版《中国热带岛屿和海岸带植物资源》、《中国热带岛屿和海岸带动物资源》、《中国热带岛屿和海岸带真菌资源》、《中国热带岛屿和海岸带红树林》等专著和《热带岛屿和海岸带生物资源保护策略》、《热带岛屿和海岸带植被恢复建议物种》等研究报告。发表一批相关研究论文。通过项目的开展，培养一批生物多样性调查与研究的年轻科研骨干和研究生。